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1.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M. Aplicação de ferramentas de biologia molecular em produção animal. In: SEMANA DO ESTUDANTE, 18., 2007, São Carlos. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2007. 14 p.

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2.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M. Genomic imprinting e suas implicações em produção animal. In: SIMPÓSIO DE BIOLOGIA MOLECULAR APLICADA À PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2007, São Carlos. São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2007. v.1 p.52-66 1 CD-ROM Editado por Luciana Correia de Almeida Regitano, Simone C. Méo.

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3.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M. Genética e epigenética do desenvolvimento embrionário inicial de mamíferos. In: SIMPÓSIO DE BIOLOGIA MOLECULAR APLICADA À PRODUÇÃO ANIMAL, 2., 2009, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2009. 17 p.

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4.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M. Protocolos genotípicos para nematoides gastrintestinais. In: CHAGAS, A. C. de S.; NICIURA, S. C. M.; MOLENTO, M. B. (Ed.). Manual prático: metodologias de diagnóstico da resistências e de detecção de sustâncias ativas em parasitas de ruminantes. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica, 2011. p. 59-82.

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5.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M. Metodologias genotípicas aplicadas à detecção de espécies de parasitas e ao diagnóstico de resistência parasitária. In: CHAGAS, A. C. de S.; NICIURA, S. C. M.; MOLENTO, M. B. (Ed.). Manual prático: metodologias de diagnóstico da resistências e de detecção de sustâncias ativas em parasitas de ruminantes. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica, 2011. p. 55-57.

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6.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M. Anatomia e fisiologia da reprodução de fêmeas bovinas. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. (Série Tecnologia APTA. Boletim Técnico IAC, 51). p. 15-27.

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7.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M. Biotécnicas da reprodução associadas à inseminação artificial. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. (Série Tecnologia APTA. Boletim Técnico IAC, 51). p. 51-71.

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8.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M.; THOLON, P. Absence of CpG observed/expected ratio depletion in Haemonchus contortus evidences a non-methylated genome. In: WORKSHOP ON OMICS STRATEGIES APPLIED TO LIVESTOCK SCIENCE, 1., 2017, Piracicaba, SP. Proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2017. p. 21. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 125) Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti,...

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9.Imagem marcado/desmarcadoSARAIVA, N. Z.; NICIURA, S. C. M. Implicações da epigenética na biotecnologia e na produção animal. In: NICIURA, S. C. M.; SARAIVA, N. Z. (Ed.). Epigenética: bases moleculares, efeitos na fisiologia e na patologia, e implicações para a produção animal e a vegetal. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 9, p. 217-258.

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10.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M.; SANCHES, G. M. Machine learning prediction of multiple anthelmintic resistance and gastrointestinal nematode control in sheep flocks. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 33, n. 1, jan./mar. 2024.

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11.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M.; PERECIN, F.; SARAIVA, N. Z. Controle epigenético do desenvolvimento e do envelhecimento em mamíferos. In: NICIURA, S. C. M.; SARAIVA, N. Z. (Ed.). Epigenética: bases moleculares, efeitos na fisiologia e na patologia, e implicações para a produção animal e a vegetal. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 7, p. 155-187.

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12.Imagem marcado/desmarcadoCRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; NICIURA, S. C. M. Genotipagem de marcadores moleculares de resistência ao parasita Haemonchus contortus em ovinos da raça Morada Nova. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 9., 2017, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Instrumentação, 2017. p. 43. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 126). Editores técnicos: Alexandre Berndt, Ana Rita Araujo Nogueira, Bianca Baccili Zanotto Vigna, Juliana Gonçalves Costa, Lea Chapaval, Manuel Antonio Chagas Jacinto, Patricia Menezes Santos.

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13.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, C. V.; CRUVINEL, G. G.; NICIURA, S. C. M. Investigação da ocorrência de eventos epigenéticos em Haemonchus contortus em estudo da resistência ao monepantel. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 9., 2017, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Instrumentação, 2017. p. 18. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 126). Editores técnicos: Alexandre Berndt, Ana Rita Araujo Nogueira, Bianca Baccili Zanotto Vigna, Juliana Gonçalves Costa, Lea Chapaval, Manuel Antonio Chagas Jacinto, Patricia Menezes Santos.

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14.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M.; SARAIVA, N. Z. (ed.). Epigenética: bases moleculares, efeitos na fisiologia e na patologia, e implicações para a produção animal e a vegetal. Brasília, DF: Embrapa, 2014. 286 p. il. color.

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15.Imagem marcado/desmarcadoNICIURA, S. C. M.; SARAIVA, N. Z. (ed.). Epigenética: bases moleculares, efeitos na fisiologia e na patologia, e implicações para a produção animal e a vegetal. 2. ed. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste; Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica, 2015. 203 p. e-book, il. color.

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16.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, C. V.; CRUVINEL, G. G; NICIURA, S. C. M. Eventos epigenéticos em Haemonchus contortus em estudo de resistência ao monepantel. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 20., 2018, Londrina, PR. Anais...Londrina, PR: CBPV, 2018. p.361. p. 361

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17.Imagem marcado/desmarcadoCRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; NICIURA, S. C. M. Variabilidade genética para marcadores SNP associados à resistência a Haemonchus contortus em ovinos Morada Nova. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p. 19. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.

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18.Imagem marcado/desmarcadoCHAGAS, A. C. de S.; NICIURA, S. C. M.; MOLENTO, M. B (ed.). Manual prático: metodologias de diagnóstico da resistência e de detecção de substâncias ativas em parasitas de ruminantes. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2011. 153 p.

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19.Imagem marcado/desmarcadoMELLO, S. S. de; DONATONI, F. A. B.; NICIURA, S. C. M. PCR-RFLP genotyping of a putative p-glycoprotein polymorphism related to multidrug resistance in Haemonchus contortus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 18., 2014, Gramado. Anais... Gramado: CBPV, 2014.

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20.Imagem marcado/desmarcadoPERECIN, F.; NICIURA, S. C. M.; LEAL, C. L. V.; GARCIA, J. M. Oocyte activation and preimplantation development of bovine embryos obtained by specific inhibition of cyclin-dependent kinases. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinaria e Zootecnia, v. 59, n. 2, p. 280-287, aapr. 2007.

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Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  18/03/2024
Data da última atualização:  18/03/2024
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 2
Autoria:  NICIURA, S. C. M.; SANCHES, G. M.
Afiliação:  SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; GUILHERME MARTINELI SANCHES, Universidade de São Paulo.
Título:  Machine learning prediction of multiple anthelmintic resistance and gastrointestinal nematode control in sheep flocks.
Ano de publicação:  2024
Fonte/Imprenta:  Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 33, n. 1, jan./mar. 2024.
DOI:  10.1590/S1984-29612024014
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The high prevalence of Haemonchus contortus and its anthelmintic resistance have affected sheep production worldwide. Machine learning approaches are able to investigate the complex relationships among the factors involved in resistance. Classification trees were built to predict multidrug resistance from 36 management practices in 27 sheep flocks. Resistance to five anthelmintics was assessed using a fecal egg count reduction test (FECRT), and 20 flocks with FECRT < 80% for four or five anthelmintics were considered resistant. The data were randomly split into training (75%) and test (25%) sets, resampled 1,000 times, and the classification trees were generated for the training data. Of the 1,000 trees, 24 (2.4%) showed 100% accuracy, sensitivity, and specificity in predicting a flock as resistant or susceptible for the test data. Forage species was a split common to all 24 trees, and the most frequent trees (12/24) were split by forage species, grazing pasture area, and fecal examination. The farming system, Suffolk sheep breed, and anthelmintic choice criteria were practices highlighted in the other trees. These management practices can be used to predict the anthelmintic resistance status and guide measures for gastrointestinal nematode control in sheep flocks.
Palavras-Chave:  Machine learning; Multidrug resistance; Random forest.
Thesaurus NAL:  Carts; Gastrointestinal nematodes.
Categoria do assunto:  H Saúde e Patologia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1162930/1/MachineLearningPrediction.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CPPSE26358 - 1UPCAP - DDPROCI-2024.00016NIC2024.00065
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